ヘックス画面で敵と接触すれば、ヤマトを実際に操艦しながらの、敵艦や敵戦闘機との砲撃戦になります。射撃はオートに設定できるので、実際には移動さえしておけばＯＫ。エネルギーやミサイルの消費をおさえたいときは、対空砲のみオートにして、自分で主砲を撃つ、というような細かい設定もできます。

　また特定のシナリオでは、敵基地や敵戦艦内でのヤマト・クルーによる白兵戦をあつかうアクションゲームになります。これも移動ポイントを指定すれば、自動で敵を攻撃するようになっています。